Sejarah singkat berdirinya Madrasah Negeri Srono Banyuwangi dapat diringkas sebagai berikut:

1. Pada tahun 1952/1953 di Desa Kebaman, Kecamatan Srono, Kab. Banyuwangi, masyarakat Islam dibawah naungan LP Ma’arif Cabang Blambangan mendirikan Madrasah PGAP.
2. Pada tahun 1967 nama PGAP Swasta Srono Kab. Banyuwangi dirubah menjadi PGAN 4 Tahun Persiapan Negeri Srono Kabupaten Banyuwangi.
3. Pada tanggal 17 Februari 1968 keluarlah SK Penegerian PGA Swasta Persiapan Negeri Srono Kab. Banyuwangi.
4. Semenjak Penegerian PGAN 4 Tahun Srono terus berkembang mengingat pada waktu itu satu-satunya Sekolah Agama Islam Negeri di Kabupaten Banyuwangi, sehingga murid-muridnya selalu berdatangan dari seluruh pelosok dalam Kabupaten Banyuwangi.
5. Untuk mencukupi kebutuhan tenaga Guru dan Karyawan TU disamping tenaga tetap (NIP.150) juga mengangkat Guru Tidak Tetap (GTT) dan TU Tidak Tetap sesuai dengan kebutuhan sekolah.
6. Para siswa lulusan PGAN 4 Tahun Srono pada umumnya melanjutkan ke PGAN Jember, PGAN Malang, dan melanjutkan ke PHIN Yogyakarta.
7. Selama itu PGAN 4 Tahun Srono belum memiliki gedung sendiri, masih menumpang/sewa kepada LP Ma’arif NU Cabang Blambangan Srono.
8. PGAN 4 Tahun Srono telah memperoleh tanah Negara dengan status Hak Pakai seluas 8.930 m2, dan dikukuhkan dengan surat Gubernur Kepala Daerah TK.I Jawa Timur tanggal 8 Desember 1973, Nomor: DA/132/SK/BSK/1973, dan Bersertifikat Tanah No.5 Tahun 1977, terletak di Desa Kebaman, Kecamatan Srono, Kabupaten Banyuwangi.
9. Dengan SK Menteri Agama No. 15,16,17, dan 19 tahun 1978 tentang perubahan Struktur Madrasah Negeri dan PGAN, maka untuk PGAN 4 Tahun Srono diubah menjadi Madrasah Tsanawiyah Negeri (MTsN) Srono Banyuwangi.
10. Dengan Keputusan Menteri Agama Republik Indonesia, Nomor: E/54/1998, Jakarta tanggal 12 Maret 1998, tentang : Penetapan Madrasah Tsanawiyah Negeri 3 Banyuwangi menjadi Madrasah Tsanawiyah Model.
11. Berdasarkan SK Kepala Kantor Kementerian Agama Propinsi Jawa Timur Nomor : Kw.13.4/1/PP.00.5/1122/SK/2011 tertanggal 09Nopember 2011 telah ditetapkan sebagai Penyelenggara  Program Kelas Percepatan Belajar.

KONDISI MADRASAH

Madrasah Tsanawiyah  (MTs) Negeri Srono beralamat di jalan Raya Srono no. 171, Desa Kebaman Kecamatan Srono, Kabupaten Banyuwangi. MTs Negeri 3 Banyuwangi Banyuwangi sebagai lembaga pendidikan umum yang berciri khusus Islam memiliki rasa tanggung jawab besar terhadap kaderisasi bangsa dalam menghadapi era globalisasi , reformasi, dan Otonomi Daerah. Meskipun letak  MTs Negeri 3 Banyuwangi Banyuwangi di Kecamatan Srono, bukan hanya menampung Calon Siswa dari Kecamatan Srono saja yang  ber  Usia  13 – 15 tahun , tetapi juga dari Kecamatan lain di wilayah Kabupaten Banyuwangi.

MTs Negeri 3 Banyuwangi juga merupakan sekolah yang memiliki jumlah siswa paling banyak ditingkat MTs/SMP yang ada di Kabupaten Banyuwangi dengan jumlah siswa 1.185 dan setiap tahun terus meningkat. pada Tahun Pelajaran 2005/2006 jumlah kelulusan siswa kelas III adalah 100 %. Faktor keluaran siswa MTs Negeri 3 Banyuwangi sejajar dengan sekolah-sekolah SMP yang tergolong favorit di Kab. Banyuwangi.

Adapun kondisi ekonomi daerah termasuk orang tua siswa yaitu 80 % petani, 5% buruh dan pedagang, 15 % TNI dan PNS. Sarana prasarana yang dimiliki MTs Negeri 3 Banyuwangi Banyuwangi sampai saat ini (2018/2019) antara lain :